工業高效液相色譜儀分類有多種。
1、按分離原理可分：工業高效液相吸附色譜儀和工業高效液相分配色譜儀。

2、按分離規模可分：小型工業高效液相色譜儀和大型工業高效液相色譜儀。

3、按色譜柱形狀可分：工業高效液相填充柱色譜儀和工業高效液相毛細管色譜儀。

4、按操作壓力可分：工業高效液相低壓色譜儀和工業高效液相高壓色譜儀。

5、按用途可分：生物色譜儀、制藥色譜儀、化工色譜儀、食品色譜儀、醫用色譜儀、蛋白質色譜儀、氨基酸色譜儀、糖類色譜儀、水質色譜儀和農藥色譜儀等。